Magia si aventura dainuie in FernGully, o padure tropicala minunata unde un liliac pe nume Batty al carui radar sonic nu mai functioneaza se alatura Crystei, lui Pips si baietilor Beetle pentru a salva lumea lor fantastica din calea nemernicului Hexxus.

Întreaga echipa a misterelor se trezește într-o locație bizară, plină de farfurii zburătoare, oameni de știință ciudați și extratereștri “prietenoși”. După ce sunt fugăriți de extratereștri și azvârliți la bordul unei nave spațiale, ceva și mai straniu li se întâmplă: se îndrăgostesc.

Scooby si echipa lui se indreapta catre Oakhaven, New England pentru o expozitie de carti de groaza. Ajunsi acolo descopera ca orasul este bantuit de fantoma unei vrajitoare malefice, iar echipa misterelor trebuie sa rezolve acest mister infiorator.

Simpaticii jucausi sunt daţi afară din casă din cauză că au făcut prea multe stricăciuni. În momentul în care se trezesc pe drumuri, ei intră într-un concurs televizat, intitulat Fabuloasa cursă, unde au marea ocazie de a câştiga un conac, pe care urmează să îl împartă frăţeşte.